После серии нападений на мутантов, совершенных загадочным противником, который способен проникать в сознание и управлять действиями людей, команда вынуждена объединиться с тем, кого они считали своим главным врагом. Вместе им предстоит проникнуть в секретную правительственную лабораторию, где обнаруживается существование темной программы, направленной на уничтожение всей мутантской расы. Внутри базы они находят молодого мутанта, чья сила способна создавать иллюзии, и узнают о плане, который может привести к геноциду. В то же время один из членов команды, обладающий способностью контролировать погоду, сталкивается с военным, который жаждет использовать ее силу для собственных целей. Параллельно другой мутант, способный проходить сквозь стены, пытается спасти своего сына, похищенного той же организацией. В кульминации команда сталкивается с истинным источником угрозы — мощным телепатом, который манипулировал всеми событиями, чтобы спровоцировать конфликт между людьми и мутантами, и теперь они должны найти способ остановить его, прежде чем мир погрузится в хаос.